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微生物学
微生物广泛存在于土壤、水系、空气、建筑环境以及生物体内,在它们栖息的各种生态系统的健康和功能中发挥着重要作用。微生物学不仅对基础科学研究至关重要,而且在公共卫生、医学、农业、工业和环境保护等领域有着广泛的应用。
病原微生物是引起人类死亡的第二大因素,不仅关系到个体和群体的健康,还涉及到公共卫生安全。通过研究病原微生物,有助于疾病预防和控制、抗微生物耐药性管理、食品安全、新药和疫苗开发等,病原微生物的研究对于保护和促进人类健康、维护公共卫生安全、推动医学科学进步和保障社会经济发展都具有不可替代的重要性。
微生物组学通过对微生物群落的不同类型和成分进行鉴定、分类和比较,揭示微生物生态系统及其对宿主和环境的影响。人体内微生物群落与癌症、胃肠道疾病、自身免疫性疾病和心血管疾病等多种疾病有关。通过研究人类微生物组,可以更深入地了解微生物对人类健康的相关性,助力于健康评估与监测、新药研发和个体化用药等。而对生态环境、工业和农业微生物组的研究有助于改善在这些环境中人群的健康,应对全球变暖,提高农业生产力,提高工业产品的寿命和功能等。
病原微生物是引起人类死亡的第二大因素,不仅关系到个体和群体的健康,还涉及到公共卫生安全。通过研究病原微生物,有助于疾病预防和控制、抗微生物耐药性管理、食品安全、新药和疫苗开发等,病原微生物的研究对于保护和促进人类健康、维护公共卫生安全、推动医学科学进步和保障社会经济发展都具有不可替代的重要性。
微生物组学通过对微生物群落的不同类型和成分进行鉴定、分类和比较,揭示微生物生态系统及其对宿主和环境的影响。人体内微生物群落与癌症、胃肠道疾病、自身免疫性疾病和心血管疾病等多种疾病有关。通过研究人类微生物组,可以更深入地了解微生物对人类健康的相关性,助力于健康评估与监测、新药研发和个体化用药等。而对生态环境、工业和农业微生物组的研究有助于改善在这些环境中人群的健康,应对全球变暖,提高农业生产力,提高工业产品的寿命和功能等。
华大智造基于自主研发的高通量测序平台,开发了多款微生物测序组合产品,覆盖公共卫生、人类微生物组学、环境微生物组学等多个领域,为传染性疾病预防与控制、人体微生态研究、生态环境科研和监测等应用场景提供精准、丰富、自动化、信息化的工具支撑。
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重要成果展示
该研究揭示了多种蚊虫在不同生境下病毒的多样性、传播分布的影响因素及地理谱系特征,在多维尺度上为研究蚊虫病毒组提供了重要的新见解。相关成果于3月22日在国际学术期刊《自然-生态与演化》(Nature Ecology & Evolution)上发表。研究团队基于华大智造自主研发的DNBSEQ-Tx超高通量测序平台,通过对单个蚊虫进行宏转录组测序,成功构建了迄今发表个体数最多、地域跨度最大的蚊虫病毒组数据资源。研究团队从中鉴定出393种蚊虫相关病毒,其中高达63%为潜在新种,包括3种潜在致病虫媒病毒新物种。这一发现大大拓展了已知蚊虫病毒的多样性和新颖性。
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中国科学院武汉病毒研究所联合国内多个研究团队,对穿山甲中发现的MERS样冠状病毒进行了鉴定和进化分析,首次发现了穿山甲作为蝙蝠病毒跨种传播的中间及适应性宿主的证据,相关研究文章“A bat MERS-like coronavirus circulates in pangolins and utilizes human DPP4 and host proteases for cell entry”发表在Cell上。华大智造DNBSEQ-T7、MGISEQ-2000测序平台为该研究中冠状病毒的精准溯源和进化分析提供了强有力的工具支撑。
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华大智造基于全新技术打造的最新款基因测序仪DNBSEQ-G99,助力此次溯源测序在短时间内得到了高度可信的毒株序列全长。面对qPCR检测Ct值为21左右的样本时,三种不同读长宏基因组测序统计猴痘病毒特异性reads平均约占0.35%。分析结果显示在读长为SE40时,猴痘病毒基因组平均深度约为35X;SE100时,其平均深度约为110X;PE100时,其平均深度约为200X,100X以上覆盖度大于99.03%。
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