ATOPlex 结核分枝杆菌扩增测序组合产品
900-000608-00,900-000611-00 |
DNBSEQ-G99ARS,DNBSEQ-G99RS 基因测序仪 |
940-001601-00,940-001599-00 |
ATOPlex MTB 建库试剂盒套装(96 RXN,576 RXN) |
940-001654-00 |
DNBSEQ 一步法DNB制备试剂盒 V4.0(4 RXN) |
940-001269-00 |
DNBSEQ-G99RS 高通量测序试剂套装(G99 FCL PE150) |
970-000397-00 |
MTB-Explorer软件(16人份) |
结核分枝杆菌 WGS 测序组合产品
900-000070-00 |
MGISP-100RS 自动化样本制备系统(标配) |
900-000560-00 |
DNBSEQ-G99ARS 基因测序仪(高配) |
940-000027-00 |
MGIEasy Fast酶切DNA文库制备试剂套装(96 RXN) |
940-000029-00 |
MGIEasy Fast酶切DNA文库制备试剂套装(16 RXN) |
1000026466 |
DNBSEQ 一步法 DNB制备试剂盒(OS_DB)(4 RXN) |
940-000410-00 |
DNBSEQ-G99RS 高通量测序试剂套装(G99 FCL PE150) |
970-000385-00 |
MTB-Explorer软件 |
推荐方案
ATOPlex 结核分枝杆菌扩增测序方案
仅需单管内2步扩增即可实现靶区域扩增建库,全流程速度快,支持15种抗结核药物耐药预测、174种分枝杆菌鉴定。
结核分枝杆菌 WGS 测序方案
可对结核分枝杆菌单菌样本进行快速、准确测序和基因组组装、实现结核分枝杆菌的基因组组装、分型鉴定、耐药预测和进化溯源分析,为结核分枝杆菌感染的精准鉴定、监测预警、溯源分析和精准防控提供工具支撑。
产品特点
样本无需培养
靶向测序的高灵敏度支持痰液、灌洗液等混合样本;无需培养 |
软件分析功能全
-覆盖WHO发布的《结核耐药相关变异目录》1所收录的一、二级1,200余个变异位点;扩增区域大小达到25.9 Kb -涵盖目录收录的15种一线、二线抗结核药物耐药信息;52个基因或基因片段的变异信息 -支持结核分枝杆菌复合群(MTBC)鉴定,spoligotype分型鉴定;174种分枝杆菌鉴定 -进化溯源分析 |
性能参数
产品名称 |
ATOPlex 结核分枝杆菌扩增测序组合产品 |
结核分枝杆菌 WGS 测序组合产品 |
预期用途 |
MTBC鉴定和分型,分枝杆菌鉴定,变异检测,耐药预测,进化溯源分析 |
结核菌株鉴定,基因组组装,变异检测,耐药信息预测,进化溯源 |
适用样本类型 |
痰液、灌洗液、培养单菌等类型样本 |
结核分枝杆菌单菌 |
推荐样本投入量 |
培养单菌提取DNA≥1 ng;痰液、灌洗液样本提取1 ng~10 ng |
DNA≥10ng |
从核酸到报告的周期 |
DNBSEQ-G99:24样本 ~26h;DNBSEQ-E25:8样本 ~30h |
20小时 |
推荐测序读长 |
PE150+10+10 |
PE150+10+10 |
推荐测序数据量 |
3 M Reads/样本 |
5M Reads |
样本报告
软件功能模块
软件包含序列检测、突变与耐药、谱系分型等模块,对单次分析的所有样本生成汇总报告,同时为任一样本提供单样本报告,点击即可打开。
耐药报告示例
汇总报告展示所有样本对应的突变与耐药信息,分别展示突变数据统计结果,耐药相关突变,不确定显著性突变、耐药不相关突变的信息、覆盖和频率信息。
汇总变异数据
耐药相关突变
不确定显著性突变、耐药不相关突变
进化溯源和样本间SNP距离分析
汇总报告将为所有测序样本自动构建进化树(左)和SNP距离分析热图(右)。
相关材料
- 文档下载【彩页】ATOPlex 结核分枝杆菌扩增测序组合产品 【快速指南】ATOPlex结核分枝杆菌扩增测序组合产品(DNBSEQ-G99ARS)快速操作指南- 940-001601-00,940-001599-00,940-001269-00 【Application Note】基于华大智造MGISEQ-2000的WGS测序技术助力新疆喀什地区结核分枝杆菌谱系分型
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