冬去春来,温度起伏,正是呼吸道传染病高发的季节。
近日,铜陵市疾控中心(以下简称“铜陵疾控”)微生物实验室通过华大智造呼吸道微生物基因组测序产品组合完成对流感病例样本的全基因组测序,成功获取了流感病毒的全基因组序列信息,对样本进行了精准的流感病毒亚型识别并揭示其内在遗传变异规律和可能影响传播力、毒力的重要突变位点。借助于全基因组测序技术在流感病毒中的应用,极大地提升了铜陵市应对季节性流感及潜在流感病毒变异株的防控能力。
在安徽省,不仅在铜陵市,马鞍山、亳州以及宣城等多地疾控中心均已使用华大智造提供的呼吸道微生物基因组测序产品组合加强流行性感冒的监测和研究。铜陵疾控自2022年部署华大智造呼吸道微生物基因组测序产品组合以来,已利用MGISEQ-200测序仪对新冠病毒基因进行测序,并在近年进一步启动宏基因组测序与流感病毒测序工作,持续提升传染病防控和各类病原体监测能力。
华大智造MGISEQ-200测序仪在铜陵疾控
作为较易发生突变、而且传染性较强的高发病率病毒,流感病毒不仅难以辨别于普通感冒,还会与新型冠状病毒的交叉流行带来叠加效应负担。因此,利用高通量测序技术对流感病毒变异进行追踪,对新型流感病毒做出预警,优化流感疫苗接种策略及流感流行趋势进行监测非常重要。
铜陵疾控工作人员处理流感病毒样本
华大智造开发的呼吸道微生物基因组测序产品组合,能够对样本进行精准的流感病毒亚型识别,获得完整的流感病毒基因组序列,有助于疾控部门或科研机构对流感病毒的追踪和溯源等工作的高效开展和快速推动。
此组合产品中的MGIEasy呼吸道微生物基因组建库试剂盒套装采用华大智造ATOPlex多重PCR技术开发而成,能够对甲型流感和乙型流感病毒全基因组8个片段进行高效地扩增和文库制备;搭配华大智造不同通量的DNBSEQ测序仪平台以及装载在华大智造生信分析加速模块MegaBOLT服务器上的MGI FluTrack基础分析系统,能够快速准备地实现对流感病毒的分型、基因组组装和溯源。此外,华大智造还开发了一系列高质量的MGISP自动化系统可搭配ATOPlex试剂盒进行建库,极大地提升通量和效率,进一步解放科研人员双手。
华大智造呼吸道微生物基因组测序产品组合提供多种通量方案
华大智造呼吸道微生物基因组测序产品组合
华大智造呼吸道微生物基因组测序产品组合,自动化程度高,数据质量优异,软件功能强大,能够为流感的变异监测和流行病学调查提供强大的工具支撑。通过对流感病毒全基因组序列的实时监测与动态分析,可以更精确地捕捉到流感疫情的发展趋势,针对可能出现新的或高致病性变异株及时发出预警,进而制定出更为科学、精准的防控策略。因此,它能够进一步助力我国流感监测工作,提高全国流感监测能力和水平,并提升全国流感监测网络对呼吸道传染病的防控能力。
在公共卫生领域,华大智造已形成病原微生物宏基因组测序、靶向测序、全基因组测序等应用场景的全流程产品组合。未来,秉承“创新智造引领生命科技”的理念,华大智造将持续研发创新,为公共卫生事件的监测和预警提供更自动、更便捷、更高效的自主核心工具。