伴随去年9月CycloneSEQ纳米孔测序技术的发布,华大智造作为华大序风的全球经销商,成为国内首个同时掌握“短读长”(DNBSEQ测序平台)与“长读长”(CycloneSEQ测序平台)测序工具的机构,基于长短读长测序技术的“双剑合璧”,构建以“全读长”(SEQ ALL)为目标的全流程工具矩阵。
2025年3月1日,华大智造SEQ ALL联盟年度峰会在杭州举办,来自不同领域的专家学者们围绕“CycloneSEQ+DNBSEQ平台”在科研、医学及产业等方向的前沿应用进行探讨,并分享了多项最新的突破性测试结果及应用成果,全方位展示了华大智造 SEQ ALL 平台的硬核实力!
国家生物信息中心研究员蒋岚:通用型高通量单细胞多组学技术分享
国家生物信息中心研究员蒋岚表示,当前单细胞测序技术面临一些需求及问题,如:该技术难以应对群体尺度的迫切需求、缺乏单细胞多模态数据以及临床试验还在最早期阶段等。其课题组的嵌入点是希望通过技术的创新去加速单细胞技术的大规模应用,从而弥补中间的差距,突破降低液滴微流控的空载率等问题,显著提升通量,同时数据质量非常高。
国家生物信息中心研究员蒋岚
苏州大学周哲敏教授:CycloneSEQ-WT02实现染色体及质粒近完全环化
当前,基于常规宏基因组进行的病原检测流程,病原体检测的敏感性与特异性不够,导致难以区分致病菌与共生菌,且无法解析菌株水平的遗传特征。苏州大学周哲敏教授团队通过全物种核心基因参考数据集,建立了ucgMLST分析流程以整合不同宏基因组流程的整合框架。
基于该分析流程,在极低覆盖深度的情况下,可实现高质量的菌株序列重建和进化分析。进一步将CycloneSEQ-WT02平台与ucgMLST分析流程结合,对碳青霉烯耐药菌进行全基因组测序,可以实现染色体近乎完全环化(N50达4.9 Mb),并在重建的83质粒中实现98.8%环化率。WT02与ucgMLST流程结合,还可精准构建细菌进化树,其结果与二代测序高度一致,为混合感染溯源和耐药传播机制研究提供了高分辨率的分子证据。
苏州大学教授周哲敏
中科院深海科学与工程研究所研究员李海松:CycloneSEQ+DNBSEQ解密海洋哺乳动物基因组
海洋哺乳动物作为研究哺乳动物水生适应性的独特模型,其基因组结构变异与种群分化机制长期缺乏高精度数据支撑。中国科学院李松海研究团队利用T1+和G400-ER平台完成多个海洋哺乳动物全基因组测序,该研究明确了不同种群间的遗传分化特征,为水生适应性演化研究与保护策略优化提供了分子基石。
中科院深海科学与工程研究所研究员李海松
中国农业大学教授胡晓湘:T1+和T7测序组合助力全球鸡基因字典研究
中国农业大学教授胡晓湘强调在海量数据中学习深层规律:不仅适用于人类语言,也适配基因组语言。目前已经做完了全球鸡基因组字典的初步工作。基因字典可以直接应用于商业化肉鸡群体的遗传选育,低深度重测序技术;同时可以利用基因字典进行GWAS研究。基于华大智造DNBSEQ-T7及T1+建立了高通量测序技术平台,执行百万级样本的重测序任务。
中国农业大学教授胡晓湘
澳门大学副教授刘子铭:T1+助力单细胞空间转录组技术
澳门大学副教授刘子铭表示课题组通过做组织的虚拟切片,在不用染色的情况下探索免疫和血管与肿瘤之间的互动关系。可视化后也可以对类器官做药效动力的评价,看到DNA的荧光报道DNA在空间的分布。T1+测序仪能快速且正确的完成空间转录文库的测序工作,通过膜染色的转基因动物模型可以展示细胞边界,精准并稀疏的转录组信息,加速下游的降维聚类等分析,期待未来实现单细胞分辨率的细胞注释。
澳门大学副教授刘子铭
杭州华大生命科学研究院研究员陈亮:CycloneSEQ单细胞全长转录组测序揭示发育调控本质
单细胞转录组的异构体复杂性,一直是发育生物学和疾病研究的核心挑战。华大生命科学研究院陈亮团队基于CycloneSEQ平台开发了单细胞全长转录组测序技术,有效数据得率与长短读长一致性均达国际领先水平。基于CycloneSEQ单细胞全长转录组的测序技术可对细胞进行更加细微特征的捕获以及细胞分群,对基因表达的复杂性进行评判还可揭示细胞异质性,研究细胞特异性的调控机制。
进一步,基于该检测平台,陈亮团队在斑马鱼胚胎发育研究中,通过CycloneSEQ单细胞全长转录组测序平台精细描绘了细胞间异质性、动态转录本使用模式以及可变剪接事件在斑马鱼早期胚胎发育进程的重要调控作用,为理解早期发育关键过程提供了全新视角。
杭州华大生命科学研究院研究员陈亮
深圳华大基因股份有限公司技术总监唐冲博士:T1+助力院端检测快速交付
深圳华大基因股份有限公司技术总监唐冲博士分享了T1+可以兼容多种文库类型,同时兼具3种规格芯片、集成了生信模块以及测序速度相较于MGISEQ-2000有极大的提升。在医学应用上测试了多种样本,做一致性检出情况时基本可以达到100%的一致性检出,整体上非常符合预期。在院端T1+搭配自动化设备DNBelab-D4实现快速交付,样本进,报告出。
深圳华大基因股份有限公司技术总监唐冲
北京吉因加科技有限公司基因研究院副院长刘涛:T1+助力吉因加肿瘤检测全流程
北京吉因加科技有限公司基因研究院副院长刘涛介绍到,现在吉因加已全部实现NGS整体解决方案国产化, 此次对T1+测序仪的验证实验采用了多款肿瘤领域的核心应用进行了联合测试,T1+在测序数据准确性上有明显提升。从肿瘤用药的应用检测结果对比来看不仅突变形态完全一致,检出的突变等位基因频率百分之百一致。总结来看,T1+平台是一个稳定可靠、性能卓越,临床检测结果安全有效的优秀的测序平台,吉因加对T1+平台在未来的临床应用中表现也充满了期待。
北京吉因加科技有限公司基因研究院副院长刘涛
南京世和基因生物技术股份有限公司高级研究员蒋文:更快速、简便、准确,T1+助力肿瘤检测
南京世和基因生物技术股份有限公司高级研究员蒋文首先介绍了T1+在测序速度、操作简便性、测序准确性提升,同时针对T1+做了多种应用的测试,T1+相较于MGISEQ-2000缩短了近50%的测序时间,实际产出和测序质量上T1+也有很高的提升,错误率上相比于MGISEQ-2000,T1+有比较大的下降,世和认为T1+可以适用于panel测序的肿瘤检测产品,也希望T1+可以在未来的肿瘤检测当中发挥其真正的作用。
南京世和基因生物技术股份有限公司高级研究员蒋文
CycloneSEQ+DNBSEQ:
让“全读长”成为科研标配
此次在会上亮相的两颗“SEQ ALL新星”——G400-ER及T1+,分别代表CycloneSEQ平台与DNBSEQ平台,为用户再次带来突破性创新与升维式体验。
G400-ER填补了国内纳米孔测序领域高通量芯片的空白,多项关键性能处于全球领先的水平,是全球单芯片设计通量最高的纳米孔长读长测序仪。它采用高密度纳米孔芯片设计,数据产出速率可达每分钟100Mb,支持100bp~Mb级别读长,高效灵活,随测随停、按需开机;它还能够高效精准检测复杂基因组,并同步检测碱基修饰。G400-ER超长读长、高数据产出和实时测序的性能,使其适用于全基因组重测序、动植物基因组检测、宏基因组测序、单细胞全长转录组测序等多种应用场景。
纳米孔测序仪G400-ER
作为DNBSEQ “十周年礼”的旗舰机型,T1+不仅是全球首款可在24小时内产出Tb级别数据的桌面式测序仪,也是全球日生产速度最快的桌面式Tb级测序仪。它与T7、G99、E25一起组成了DNBSEQ测序仪的“极速全家桶”,实现从Gb级至Tb级不同通量均支持24小时内交付数据,全面开启测序「天」时代。
T1+以更快速,更灵活、更易用的方式,推动行业进入“文库上机、数据当日达”的时代。它是速度更快的“全能王”,单次通量覆盖25Gb-1.2Tb,能够在24小时内一键完成DNA文库的PE150测序任务,完成SE50测序最多只需7小时;它支持1~2张载片独立运行以及不同测序读长需求,PE150级测序的Q40>90%;它“一键启动,一气呵成”,首次将DNB制备功能集成到设备内部,支持多种类型的上机文库(dsDNA、ssCirDNA、DNB)。“一机多用”的T1+,不仅能够满足广泛应用领域的需求,更能支持 “一个人”的多组学研究。
桌面式Tb级测序仪T1+
基于“CycloneSEQ+DNBSEQ”平台,华大智造实现为全球用户提供 SEQ ALL 全流程工具。未来,华大智造及华大序风将继续携手,发挥各自所长,持续推动基因测序通量、速度、读长、准确率及测序成本等各个关键指标突破,让基因测序更可及、让生命皆可测。