CycloneSEQ-WT02纳米孔测序平台能够跨越细菌基因组中的复杂区域，能够实现一次性获得细菌基因组完成图。此外，CycloneSEQ技术在研究基因组重复区域、功能和适应性方面具有明显优势。

测试结果

PART.1

测序长度、质量结果

共测序三次，每次测序选取12个样本pooling在一张芯片。建库后用CycloneSEQ-WT02测序，随着测序时间的延长，数据产量逐步上升。平均每张芯片测序产生12Gb的数据量，平均每个样本产出1G左右数据量。

表1 三张CycloneSEQ芯片的测序结果

图1  36个基因组的完整度与基因组连续性（Contig数量）

测序产出数据随时间的变化有以下几个方面（以第一次测序产出为例）：

图2 第一次测序产出的base随时间增加曲线

图3 第一次测序reads产出随时间增加曲线

表2 第一次测序每个 barcode产出信息

每次上样均含有1-3个低起始量样本，测序结果数据量与上样起始量基本对应。总体看来，单个样本产量较均一，读长比较稳定。

PART.2

仅CycloneSEQ测序基因组与参考基因组（完成基因组）比对

利用CycloneSEQ测序平台细菌基因组解决方案对某细菌（命名为Bacteria1，下同）测序分析得到了组装结果如表3、表4及图4、图5所示。

将Bacteria1菌株的CycloneSEQ测序组装基因组与该菌株的参考基因组做比对：

表3 Bacteria1组装策略和结果统计

表4 Bacteria1与参考基因组比对统计

图4 Bacteria1与参考基因组比对情况

图5 Bacteria1基因组注释图谱

PART.3

环状质粒的完整测序及组装

Cyclone的长读长测序能够将菌株基因组外其他DNA序列准确并完整地测序。

表5 部分菌株质粒信息

表6 Bacteria2菌株组装结果统计

图6 bacteria2的基因组图谱

测试结论

此次测试结果显示，山东大学微生物改造技术全国重点实验室能够充分利用CycloneSEQ纳米孔测序平台的优势，完成细菌基因组组装。

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