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用户测评 | 承葛生物基于G99平台的肠道菌群基因检测方案

时间:2023-11-02作者:华大智造阅读数:5302分享

肠道菌群是“人体的第八大器官”,人类肠道内细菌种类超过1000种,菌群细胞总数4×1013个,基因数目约330万个,是人体自身基因数目的150倍,在食物营养消化吸收、肠道屏障功能、调节胃肠道激素分泌以及先天免疫系统的激活中发挥着重要作用。


肠道菌群基因检测指从粪便样本中提取细菌DNA,通过高通量测序分析,并将其与现有健康肠道菌群数据库进行对比,以此为依据生成检测报告。报告描述受检者肠道微生物结构及多样性,尤其是肠道功能核心菌群的含量及构比,监测肠道中的益生菌、条件致病菌以及致病菌,预测相关疾病发生风险,为亚健康状态及疾病的诊断、干预提供有力数据支撑。


为了准确鉴定肠道菌群的种类及丰度,提升检测效率,承葛生物推出基于华大智造DNBSEQ-G99测序平台的人类肠道菌群基因检测产品,在G99平台极速、灵活、高性价比的优势助力下,交付周期从48小时缩短至24小时,极致提升了交付速率,同时,获得了准确、可靠的检测结果。



注:图片及背景介绍来源于承葛生物


01 产品方案

提取建库:承葛生物人类粪便肠道菌群核酸提取试剂、承葛生物肠道菌群基因检测试剂盒

(采用靶向扩增技术,针对微生物16S基因进行检测,适用于多种测序平台的文库构建和上机测序。)测序方案:华大智造DNBSEQ-G99 (PE150测序)分析方案:承葛生物配套分析方案


02 检测流程


注:检测流程来源于承葛生物


03 对比测试结果

(1)ZymoBIOMICS® Gut Microbiome Standard选用ZymoBIOMICS® Gut Microbiome作为标准样本在G99上进行测序,对比菌种检出和丰度测算情况。采用承葛生物肠道菌群检测产品在G99上进行验证,菌种情况一致。以下为部分菌种检测结果。


(2)样本测试选用经过验证的混合菌样本,分别进行8次的重复实验,计算相应的CV值,主要菌群的CV值≤5%。G99为菌群检测提供了稳定可靠平台。


注:对比测试结果来源于承葛生物


04 基于G99平台的肠道菌群检测方案优势

(1)极速交付效率

G99可在12小时内完成PE150测序,配套承葛生物分析报告系统,可实现一键启动任务,项目交付周期最短24小时,能够为患者提供更迅捷的治疗决策。


(2)智能化实验流程

G99具有简单、灵活的特点,上机方案更多样,操作界面更智能,确保实验室人员能够方便、准确地进行检测,适应多样化的应用需求。承葛生物实现从样本核酸提取到最终报告出具全流程生产管线的自动化,减少人为误差。


(3)精准检测结果

G99采用华大智造核心的DNBSEQ测序技术,具有高准确性、低重复序列、低标签跳跃等优势,助力客户获取准确的检测结果。承葛生物基于10万+肠道菌群测序大数据,通过生信构建数据模型,精准评估肠道菌群健康情况。


DNBSEQ-G99帮助用户在肠道菌群检测的应用中24小时内极速获取准确的检测结果,为高通量测序技术在肠道菌群检测拓展了更多的应用场景。随着G99获批国家药品监督管理局(NMPA)医疗器械注册证,G99将全方位解锁临床应用领域。G99以其极致的测序速度、灵活简单的上机体验、高效多样的测序选择,持续赋能用户,助力行业发展。

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