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用户测评 | 开泰生物基于华大智造DNBelab C-TaiM 4平台推出水稻茎单细胞检测方案

时间:2024-10-12作者:华大智造阅读数:511分享

在植物生物学的领域中,细胞间的异质性研究已成为解锁植物生长发育复杂机制的关键钥匙。华大智造DNBelab C系列单细胞一站式平台包含从样本保存、样本制备、文库制备、上机测序到数据分析的全流程工具,在多个热门研究领域具有广泛的应用,尤其在植物领域取得了显著成果。开泰生物拥有成熟和稳定的原生质体制备方案,搭配DNBelab C-TaiM 4单细胞液滴生成仪和DNBSEQ-T7超高通量测序平台,为水稻茎部组织的单细胞研究提供了高效、精准、全面的解决方案。


华大智造DNBelab C系列单细胞一站式平台


01材料与方法


02实验流程


开泰生物植物单细胞的实测数据展示


1.高数据产出:

在DNBelab C-TaiM 4的精准单细胞捕捉与DNBSEQ-T7的高通量测序平台双重赋能下,对两个水稻样本提原生质体进行单细胞实验,从质控数据结果显示:两个样本生物学重复较好,并展现出了极高的产出量和良好的质量,细胞捕获数均在8,000左右,基因检出数都在1,900左右,充分验证了该实验方案的稳定性和可靠性。



2.细胞分群和鉴定:

细胞聚类分群后,通过已发表文章查找Marker基因、搜索水稻数据库,注释鉴定出9种细胞群,完成了水稻茎单细胞图谱构建,细胞类型详见UMAP图。



测评总结


在开泰生物基于DNBelab C-TaiM 4平台进行的植物水稻茎部组织的单细胞检测的研究中,无论从水稻茎部组织原生质体的质量、单细胞测序实验结果数据的稳定性和可重复性、还是基因的检出数方面均表现优异。作为支持该研究的核心技术平台,DNBelab C系列产品以其强大的兼容性和高效性为科研工作者提供稳定和可靠的数据产出,极大地提升了科研工作的效率和准确性。


开泰生物作为华大智造DNBelab C系列高通量单细胞RNA文库制备认证服务商,长期专注于高通量单细胞多组学的技术研发与服务,在植物单细胞的研究中具有丰富经验,尤其是植物原生质体制备。目前成功解离了近千例植物组织样本,建立20+植物、30+组织部位的原生质体制备体系。


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