《你问我答》栏目搜集了华大智造客户的常问问题,并为大家整理出了不同产品的FAQ,后续将陆续发布,帮助您更好地了解和使用我们的产品。
Q1:DNBSEQ-T7每年可检测最多多少样本量?
单台DNBSEQ-T7满负荷365天可完成20440例 30× WGS样本的检测(*30× WGS样本数据量按100Gb测算)。
Q2:DNBSEQ-T7的拆分速度是多少?
如果使用ZTRON Lite拆分,一张芯片,PE100大约1个小时左右,PE150约1.5个小时左右;
如果使用ZTRON Pro拆分,一张芯片,PE100约在0.4个小时内,PE150约在0.5个小时内。
Q3:DNBSEQ-T7系统是否有数据自动管理的功能?
DNBSEQ-T7系统具备数据自动管理功能,支持图片和zebracall metrics文件的自动删除,cal文件默认不删除。
Q4:DNBSEQ-T7搭配哪款生信分析平台可以进行高级分析(二级生信分析)?
ZTRON Pro。
Q5:DNBSEQ-T7是如何实现写FASTQ的?
DNBSEQ-T7测序完成后生成的是cal.文件,使用cal.文件写FASTQ。写FASTQ推荐在Ztron Lite上完成,当然也可以选择在T7本地完成。T7内服务器本地写FASTQ大约需要3-4小时一张芯片,写FASTQ时候不可以测序。
Ztron lite写FASTQ时T7可以正常测序,在PE100测序中,写FASTQ任务:1 小时/FC,4 小时/4 FC;在PE150 测序中,写FASTQ任务:1.5 小时/FC,6 小时/4 FC。
Q6:DNBSEQ-T7通量大(7T/run),单次样本数太少会不会造成数据量浪费?
不会造成浪费,DNBSEQ-T7通量大,但是4张芯片相对独立运行,可以按照样本要求选择单次上机1/2/3/4张芯片,可以随时上机其他芯片,芯片之间互不影响。除此之外,我们也有更小通量的机型可供选择,可以根据您的应用需求进行精准的推荐。
Q7:DNBSEQ-T7测序试剂套装包含哪些试剂盒?
测序载片、DNB加载试剂盒、DNB制备试剂盒、测序试剂盒、清洗试剂盒。
Q8:DNBSEQ-T7和DNBSEQ-T7RS测序试剂可以通用吗?
不可以,若进行临床应用,必须使用IVD仪器搭配DNBSEQ-T7 IVD试剂。
Q9:DNBSEQ-T7RS高通量测序试剂无法立刻使用时应该如何保存?
关于DNBSEQ-T7RS 高通量测序试剂暂存:
◾如试剂盒已经融化(包括 dNTPs),且不能按时使用,最多可再冻融一次。
◾如试剂盒已经融化(包括 dNTPs ),且不能按时使用,可放在 4℃内暂存,并于 24 小时内使用,7 天内可风险上机。
◾如 dNTPs 和 DNA 聚合酶混合液已经加入试剂盒中,即试剂盒已经准备完毕,若不能及时使用,可放在 4℃内暂存,并于 24 小时内使用,7天内可风险上机。
◾如 dNTPs 和 DNA 聚合酶混合液已经加入试剂盒中,即试剂盒已经准备完毕,且已经在仪器上下针,若不能及时使用,务必使用锡箔纸或保鲜膜密封,可放在 4℃内暂存,并于24小时内使用,7 天内可风险上机。
DNBSEQ-T7产生的液体化学废弃物为7L/日(单张载片以PE150模式运行)、28L/日(四张载片以PE150模式运行)。
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